MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022784	A	6	6	784115	784120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_022784	GAAA	2	8	784125	784132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_022784	TACA	2	8	784169	784176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_022784	TCA	2	6	784195	784200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_022784	CGAT	2	8	784678	784685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5506	NC_022784	CA	3	6	784722	784727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_022784	AACC	2	8	784729	784736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_022784	GCC	2	6	784739	784744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_022784	CCG	2	6	784807	784812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_022784	AC	3	6	784903	784908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_022784	GCT	3	9	784926	784934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_022784	ACC	2	6	784938	784943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_022784	ACC	2	6	784997	785002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_022784	ATC	2	6	785009	785014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_022784	GTT	2	6	785061	785066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022784	ATA	2	6	785077	785082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022784	CA	3	6	785143	785148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_022784	GAA	2	6	785859	785864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_022784	TAT	2	6	785944	785949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_022784	CTG	2	6	785960	785965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_022784	CG	3	6	785989	785994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_022784	TGGG	2	8	786155	786162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_022784	TCC	2	6	786167	786172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_022784	AT	3	6	786202	786207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_022784	TCA	2	6	786219	786224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_022784	A	6	6	786261	786266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_022784	CCG	2	6	786278	786283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_022784	TAT	2	6	786289	786294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_022784	CT	3	6	786340	786345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_022784	ACC	2	6	786389	786394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_022784	GGA	2	6	786421	786426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_022784	GGA	2	6	786436	786441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_022784	C	6	6	786442	786447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5534	NC_022784	CAG	2	6	786513	786518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_022784	TTC	2	6	786632	786637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_022784	CAGCT	2	10	786655	786664	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5537	NC_022784	CGC	2	6	786784	786789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_022784	G	6	6	786805	786810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_022784	CAA	2	6	786836	786841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_022784	CCCA	2	8	786930	786937	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5541	NC_022784	ACGT	2	8	786955	786962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_022784	ATC	2	6	787009	787014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_022784	AGC	2	6	787060	787065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_022784	AGC	2	6	787089	787094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_022784	TG	3	6	787114	787119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_022784	ATC	2	6	787132	787137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_022784	ATC	2	6	787293	787298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_022784	AT	3	6	787306	787311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_022784	ATT	2	6	787324	787329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_022784	GA	3	6	787360	787365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_022784	ACG	2	6	787388	787393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_022784	N	620	620	787432	788051	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_022784	AT	3	6	788062	788067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_022784	GCT	2	6	788081	788086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_022784	AG	3	6	788098	788103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_022784	CTT	2	6	788107	788112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_022784	TAG	2	6	788152	788157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_022784	AGC	2	6	788171	788176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_022784	CAT	2	6	788191	788196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_022784	CCA	2	6	788210	788215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_022784	AAGC	2	8	788292	788299	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_022784	TCA	2	6	788321	788326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_022784	GCT	2	6	788341	788346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_022784	TG	3	6	788382	788387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_022784	ACT	2	6	788488	788493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_022784	TGG	2	6	788571	788576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_022784	CGT	2	6	788607	788612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_022784	ACA	2	6	788672	788677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_022784	GC	3	6	788701	788706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_022784	ACA	2	6	788727	788732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_022784	CACT	2	8	788772	788779	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_022784	GATC	2	8	788781	788788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_022784	CAC	2	6	788923	788928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_022784	CTG	2	6	788948	788953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_022784	AGAATC	2	12	788959	788970	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5577	NC_022784	CAA	2	6	789063	789068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_022784	CA	3	6	789081	789086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_022784	AC	3	6	789115	789120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_022784	AAC	2	6	789126	789131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_022784	CCG	2	6	789140	789145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_022784	ATT	2	6	789220	789225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_022784	CTTGA	2	10	789229	789238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5584	NC_022784	TTC	2	6	789272	789277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_022784	TGC	2	6	789324	789329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_022784	CAA	2	6	789466	789471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_022784	AAG	2	6	789494	789499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_022784	TGC	2	6	789501	789506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_022784	AGAA	2	8	789517	789524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_022784	TGG	2	6	790309	790314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_022784	TAGTGG	2	12	790396	790407	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_022784	CTGT	2	8	790452	790459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_022784	AGGG	2	8	790486	790493	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_022784	AAC	2	6	790494	790499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_022784	AC	3	6	790505	790510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_022784	GCCTGT	2	12	790675	790686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_022784	GAA	2	6	790740	790745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_022784	AGA	2	6	790815	790820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_022784	TG	3	6	790831	790836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_022784	GTGCT	2	10	790869	790878	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5603	NC_022784	AAG	2	6	790901	790906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_022784	ATC	2	6	791004	791009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_022784	AAG	2	6	791297	791302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_022784	TCC	2	6	791346	791351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_022784	TAA	2	6	791368	791373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_022784	TGA	2	6	791399	791404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_022784	GCG	2	6	791431	791436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_022784	ACT	2	6	791449	791454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_022784	CGC	2	6	791459	791464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_022784	N	927	927	791473	792399	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_022784	CTA	2	6	792452	792457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_022784	CAG	2	6	792470	792475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_022784	ACT	2	6	792564	792569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_022784	GCC	2	6	792588	792593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5619	NC_022784	CCG	2	6	792642	792647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_022784	CA	3	6	792654	792659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_022784	CCT	2	6	792667	792672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_022784	TCC	2	6	792675	792680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_022784	ATT	2	6	792698	792703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_022784	ATC	2	6	792760	792765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5628	NC_022784	TAAACA	2	12	792851	792862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5629	NC_022784	T	6	6	792869	792874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_022784	GAAG	2	8	793430	793437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_022784	ACC	2	6	795269	795274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5632	NC_022784	AT	3	6	795325	795330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_022784	AAT	2	6	795331	795336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5635	NC_022784	CGG	2	6	795367	795372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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